Axel Olai Heikelin arkisto sisältää runsaasti sekä kansatieteelliseen tutkimukseen että yksityiselämään liittyviä aineistoja. Mukana on biogafista aineistoa, kuten ansioluetteloita, kirjeenvaihtoa, postikortteja, puheita, referaatteja, käsikirjoituksia, päiväkirjoja, muistiinpanoja, lehtileikkeitä, painotuotteita, valokuvia, karttoja ja piirustuksia sekä tutkimustyöhön ja viranomaistoimintaan liittyviä aineistoja. Mukana on myös perheen aineistoa, kuten Heikelin tyttärien kirjeenvaihtoa, kouluaineita, piirustuksia ja valokuvia.
Museoviraston Kuvakokoelmat vastaavat valokuvien hallinnoinnista, myös arkistoaineistoihin liittyvät valokuvat ovat pääosin Kuvakokoelmilla. Arkistoaineistojen joukossa voi kuitenkin joissain tapauksissa olla kuvavedoksia, esim. arkeologiaan liittyvissä aineistoissa on usein kuvatauluja (= taustapahville kiinnitettyjä vedoksia, joiden yhteydessä on kuvatekstejä). Kaikki alkuperäiset kuva-aineistot, kuten negatiivit ja diat ovat kuitenkin aina Kuvakokoelmilla, samoin valtaosa vedoksista. Henkilöittäin arkistoiduissa aineistoissa valokuvista saattaa olla tarkempia mainintoja erityisesti F-sarjassa (Valokuvat). A. O. Heikelin piirustus- ja kartta-aineistoa on myös Museoviraston arkiston Ibd-sarjassa yksiköissä Ibd:2-3.
